从泛古大陆回来的龙翔在中华恐龙园的化石展览厅内偶遇了暴宝，从而发现了一个惊天大秘密。原来史前的恐龙并没有完全灭绝，在恐龙族大长老的竭力保护下，二十几颗恐龙蛋避免了史前的灾难而得以了保存。在地下的洞穴里，大长老和刚孵出的小恐龙们快乐地生活着，但活泼好奇的小恐龙企图通过远古的时空魔法回到过去，扰乱人类历史文明的发展，从而达到使恐龙重返地面，在蓝天白云下自由生活的目的。小恐龙的恶作剧给现代的人类社会造成了巨大的影响，得知内情的龙翔和从泛古大陆赶来助阵的伙伴们在爷爷发明的时空道具的帮助下穿越了一个个时空，和史前小恐龙们展开了一场场斗智斗勇，诙谐搞笑的争斗。通过龙翔和伙伴们的努力，保护了人类的历史文明，并说服了恐龙大长老，共同联手使地球避免了灭顶之灾。最终在恐龙园里实现了史前恐龙和现代人类和谐共存的梦想。